八月下旬，朱由检对大明朝廷进行了一次大规模的官员调整。
南京朝最重要的两个部门就是户部和兵部，这也是两个最让朱由检比较放心的部门，因为自从朱由检南渡之后，对这两个部门的人员安插一直都在进行。
一年之后，这两个部门下属的各司各衙门已经基本上都是朱由检的人了。其中有一大半，都是朱由检从京城带着一起南下的那些忠诚度最高的京城官员。
兵和钱，永远都要掌握在自己的手中方才睡得着觉，这是当好一个管家首先要做的事。所以，陈子龙直接去了户部，做了方岳贡手下的左侍郎而史可法手上根本就没有兵权，纯粹就是朱由检安插在兵部里面一个补漏洞的。
黄道周升任礼部左侍郎，掌翰林院和国子监，另外负责文教事物，礼部下设的四个清吏司仪制、祀祭、主客、精膳等，也都换了人，原来的官员全部外调至两广，当了地方官，算是补了实缺。朱由检这样做，等于是把钱谦益架空了，实际上钱谦益当礼部尚书也没多久，培植的党羽还不算很多。
马士英任吏部尚书，从进士科中选拔的人才充任各司各衙门，基本上算是稳定了吏部的正常运作。
吕大器调任云贵川三省总督，姜曰广任刑部尚书工部在南京朝地位最低，高弘图任工部尚书朱聿键直接正式接管了宗人府。顾炎武带着几个人直接去了都察院，接受了整个都察院的工作，其中有四分之一的明法生被他带了进去。
在这场人事调整中，最大的意外是黄宗羲接替了陈子龙的的位置，担任通政使兼皇帝办公室主任，掌管内外章疏敷奏封驳之事。正式进入了朱由检随身的幕僚团队。并且和左懋第一起，组成了朱由检身边最重要的文武双编。
袁继咸升任南直隶总督张同敞任大理卿张国维任都察院左都御史。
由此，南京六部等主要衙门经过一年的调整之后，算是配置齐全了。之所以没有对朝制作更改，一是朱由检没有这个水平，二是大明的朝局还不稳定，还有大量的朱由检摸不清底细的人充斥着整个朝野。
经过了一年的努力，朱由检总算是松了一口气，这大明朝局的摊子算是铺开了。
钱谦益和刘宗周感到非常头疼，因为新的朝局也让他们捉摸不定。从表面上看，新升上来的人都带有东林或者是复社的背景，重要的是这些人都没有明确的支持东林党的心思。一个特别明显的现象是，皇帝朱由检正在拼命的培养自己的人手，比如陈子龙。短短两年时间，就从一个普通的人直接升到了户部左侍郎的位置，这是准备接手户部的节奏。
刘宗周心里暗暗盘算了一遍，他发现现在的朝局有点像天启朝，东林在朝中并非一家独大，他们为了扩张开始打压异己，最终导致齐党、楚党的人投靠了阉党，真正掌权的却是魏忠贤。因为魏忠贤掌管内外章疏敷奏封驳之事。
现在的朝局里，东林虽然占优，可是其他新势力也控制了重要部门，而且刘宗周的那个扫地出门的弟子掌了管内外章疏敷奏封驳之事。
刘宗周后悔啊！早知道这小子会这么有用，就不该把他扫出去的。控制了奏章，就等于控制了皇帝啊。想想魏忠贤，东林人会直接流口水。
“念台兄，您再去找黄宗羲说说，毕竟是师徒一场。”钱谦益恨死这个猪队友了，关键时候掉链子。
“我怎么去？朱由检现在直接接管了朝政，太子又没有监国了。那个臭小子直接住到了将军山，我还能见得着他”
“那就先从太子哪下手，我就不信朱由检不离开南京。”
“怎么下手？太子那个监国也就是个样子货，根本就做不了主。”
“那也不一定。机会总是会有的，先把太子拉到我们这边来再说。”
“我听人说太子