对于毛文龙，袁崇焕已经忍了很久了，匹夫无礼，毛文龙前来拜谒他，袁崇焕以上宾之礼接待毛文龙，毛文龙也不谦让。
真当我袁大督师的剑不利吗？这般没有规矩，没有礼数！
五月，袁崇焕以阅兵为由，乘船到达双岛，毛文龙前来会面。
就这样，袁崇焕同他设宴饮酒、行乐，每每到半夜才罢，不管我心里怎么想收拾你，但是表面上还是得过的去，袁崇焕可是智谋无双的，毛文龙没有觉察袁崇焕的意思。
这天，趁着喝点差不多了，袁崇焕遂开口说道：“振南，此番必须得更改一下东江军营的制度了，这军中设置监察官员本就是规矩，难道你这例外不成，莫不是你想拥兵自重？”
“督师此言差矣，这些监察官员有何用？平白指手画脚，打仗，还是得我们武将来，那些文官可不行？当然，督师我不是说你啊”。
毛文龙摆了摆手，显然是不高兴了，来了文官对我制肘，这不能行！
“这可不好办，你这边口子一开，日后各地将士争相效仿，岂不天下大乱，要不你辞官回乡吧！我找人接替你，这样上下都能说的过去”
袁崇焕边喝酒边说，对于这件事情他已经很不满意了。
毛文龙也是面带不高兴：“其实我早就想回乡了，奈何后金鞑子势大，只有我知晓这边的事务，等消灭后金鞑子，朝鲜衰弱，可以袭击占有”。
袁崇焕此时颇为不满，玛德，良言难劝该死的鬼？你怎么就这么不听话呢？还想裂土封王？
本来没有真的想杀你，我袁崇焕还真没有这个权力，可是不行也得行了。
宴席不欢而散！
六月四日晚，袁崇焕已经决定动手了，可是这里毕竟是毛文龙的地盘，这个还得好好谋划一番。
“尚政，这毛振南还真的是无可救药，明日你在山顶设置帷帐，你安排身穿铠甲的士兵埋伏在帐外，听我命令，到时候他的手下将士都不能放进来，要不然容易引起哗变”
袁崇焕已经设计好了，明日在这皮岛擒杀毛文龙。
六月五日，袁崇焕请毛文龙来观看将士们射箭，在山顶已经设置好了帷帐。
毛文龙一到，身后还跟着不少将领和亲兵。
袁崇焕说：“振南，我明天出发，海外的事情全寄托在你身上了，请受我一拜。”
互相拜见之后，就一起登上山来。
袁崇焕一时兴起问他随从军官的姓名，他打起感情牌来，这个时候必须得让毛文龙放松警惕才行。
毛文龙说：“这些人都是我的子孙”。
毛文龙一通介绍下来，让袁崇焕心里更不舒服了，但是表面还得笑呵呵。
这十个人里有九个你的义子义孙，你再用人唯亲也不用这样吧？
袁崇焕笑了笑，说道：“你们在海外劳苦多日，每月禄米也只有那么一斛，说起来还真是让人痛心呢，请受我一拜，大家都为国家尽力。”
毛文龙也就罢了，手下这些人哪敢接受袁崇焕的行礼。
这些人都是都叩头道谢，大明朝文贵武贱，何况是面对袁督师的行礼。
表面功夫做足后，袁崇焕便请毛文龙进帷帐休息，其他将士亲兵你就拉倒吧，帷帐等着吧，没资格进。
进了帷帐袁崇焕就准备翻脸了！
“振南，我这有人举报说你暗中私通东虏，贪污军粮等，你作何解释！”袁崇焕就此诘问毛文龙几桩违令的事情。
“督师怎可如此说，对于东虏，我那只是诱饵，骗他们多派使臣，诱杀而已，贪污军粮更是无稽之谈”
毛文龙做了对抗性的辩解，这种事情怎么能认呢？
“岂有此理，你和东虏私通还敢狡辩，你看看你手下将士，缺衣少粮，军饷拖欠，还敢说没有贪污，来人，扒下他的帽子和袍带，把他捆了起来”
袁崇焕高声喝斥他，毛文龙仍很倔强，不服气，你想治我罪，可没那么容易。
此时毛文龙还没反应过来，只见袁崇焕接着说道：“你有十二条该斩头的大罪，知道吗？按我朝祖宗定下来的制度，大将领兵在外，必须接受文官的监视。你在这边一人专制，军马钱粮都不接受核查，一该杀”。
“大臣的罪没有比欺骗君主更大的，你送上奏章全都蒙骗，杀害投降的士兵和难民，假冒战功，二该杀”。
“大臣没有自己的将领，有则必杀。你上书说在登州驻兵取南京易如反掌，大逆不道，三该杀”。
“每年饷银几十万，不发给士兵，每月只散发三斗半米，侵占军粮，四该杀”。
“擅自在皮岛开设马市，私自和外国人来往，五该杀。”
“部将几千人都冒称是你的同姓，副将以下都随意发给布帛上千匹，走卒、轿夫都穿着品官官服和袍带，一点规矩没有，六该杀。”
“从宁远返回途中，劫掠商船，自己做了盗贼，七该杀。”
“强娶民间女子，不知法纪，部下效仿，使得百姓不安于家，八该杀。”
“驱使难民远远去帮你盗窃人参，不听从的就被饿死，岛上白骨累累，九该杀。”
“用车送金子到京师，拜魏忠贤为父，并在岛上雕塑他加冕冠的肖像，十该杀。”
“铁山一战败北，丧师不计其数，却掩败为功，十一该杀。”
“设镇八年，不能收复一寸土地，坐地观望，姑息养敌，十二该杀。”
这么多条罪名宣布完后，毛文龙丧魂失魄，说不出话来，竟然服软了，叩头请袁督师免他一死。
这些罪名都是袁崇焕准备好的，杀人总要有个理由吧，其实这时候袁崇焕也是有些骑虎难下的，按朝廷律法他是没有权力杀毛文龙的。
袁崇焕对着身旁的部将说：“毛文龙这样的罪状，该不该杀他？”
大家都怕得唯唯诺诺，谁敢反对？怕是会和毛文龙一个下场，你袁督师说什么是什么呗
这时候参将谢尚政开口说道：“督师，这毛帅毕竟还是有些功劳苦劳的，如此怕是很难收场啊”。
你这时候杀了毛文龙，就不怕外面的人造反？
“住口，毛文龙本是一个平民百姓罢了，官做得最高，全家都得以荫封，足够报他的辛劳了，他怎么就这样悖乱违逆呢！”袁崇焕呵斥了他一声，显得很不满，你到底哪一头的？
“我今天杀毛文龙以整顿军纪，将领中间有和毛文龙一样的，都要杀了他们，我不能成功的话，请皇上也像杀毛文龙一样杀了我。”
袁崇焕跪地朝着紫禁城的方向拜去，基本上到了毛文龙这个职位，袁崇焕是没有权力处决毛文龙的，尚方宝剑也不好使。
尚方宝剑的权力也是有限的，也就斩杀四品以四品以下官员，这也是为什么赵津南小心应对袁崇焕的原因，要是袁崇焕看他不顺眼基本上找个理由就可以无责杀掉他。
但这个时候斩杀毛文龙可不行，袁崇焕可没有皇上的圣旨，这属于矫诏。
可是袁崇焕可不管这个，不听话的人留之何用？再说了你毛文龙犯了这么多律法，非斩杀不可！
于是袁崇焕取下尚方宝剑在帐前把毛文龙的头砍了下来。