闻孙思邈游于少室，召至，治之寻愈，诏拜谏议大夫，固辞，请归养病。上不许，特赐良马及鄱阳公，主邑司以居焉。当时名士，如宋之问、孟诜、卢照邻等，皆师礼之。
初，魏征等受诏修齐、梁、周、隋、陈五代史，恐有遗漏，访于思邈，口以传授，有如目睹。东台侍郎孙处约尝将其五子侹、儆、俊、侑、佺谒问，思邈曰：“俊当先达，侑晚成，佺最居重位，祸在执兵。癸酉夏，帝幸九成宫，思邈从驾往。
时照邻以恶疾就药于思邈，因感而问曰：“高医愈疾，其道如何?”
思邈曰：“吾闻善言天者，必质于人；善言人者，必本于天。天有四时五行，寒暑迭代，其转运也，和而为雨，怒而为风，凝而为霜雪，张而为虹霓，此天地之常数也。人有四肢五脏，一觉一寐，呵吸吐纳，循而为往来，流而为荣卫，彰而为气色，发而为音声，此人之常数也。阳用其精，阴用其形，天人之所同也。及其失也，蒸则生热，否则生寒，结而为疣赘，陷而为痈疽，奔而为喘乏。竭而为焦枯，诊发乎面，变动乎形，推此以及天地，则亦如之。故五纬盈缩，星辰失度，日月错形。簪孛流飞，此天地之危疹也；寒暑不时，此天地之蒸否也。山立土踊，是其疣赘；山崩地陷，是其痈疽；奔风暴雨，是其喘乏；雨泽不时，川源涸竭，是其枯焦也。良医导之以药石，救之以针剂；圣人和之以道德，辅之以政治，故体有可愈之疾，天有可消之灾。”
照邻曰：“人事奈何?”
曰：“心为之君，君尚恭，故欲小，《诗》曰：‘如临深渊’，‘如履薄冰’。谓小心也。胆为之将，以果决为务，故欲大，‘赳赳武夫’，‘公侯干城’，谓大胆也。仁者静，地之象，故欲方，不为利回，不为义疚，行之方也。智者动，天之象，故欲圆，见机而作，不俟终日，智之圆也。”
复问养性之要，答曰：“天有盈虚，人有屯危，不自慎不能济也，故养性必先知自慎也。慎以畏为本，士无畏则简仁义，农无畏则堕稼穑，工无畏则慢规矩，商无畏则货不殖。子畏则孝，父畏则慈，臣畏则勋立，君畏则乱治。是以太上畏道，其次畏天，其次畏物，其次畏人，其次畏身。忧于身者，不拘于人，慎于小者，不惧于大；戒于近者，不悔于远，如此，则人事毕矣。”照邻拜谢其教。思邈庭前有病梨树，照邻为之作赋以自悲，并序其生平焉。
乙亥春，帝患泄，太医令主补脾，思邈独谓补脾不如补肾，遽用金匮肾气饮，泄立止。帝好静摄，使后摄政。后鸩太子弘，立贤为太子。
丙子改元仪凤。以狄仁杰执法敢言，擢为侍御史。未第时，假医药济人，尝赴并州法掾，登太行山，见白云孤飞，泣曰：“吾亲舍在其下也。”
己卯改元调露。突厥都支与吐蕃连侵安西，侍郎裴行俭送波斯王子归阳为亩猎，擒都支以归。是秋，蜀中道士言祖刘师有法宝藏于山中，今时主当出。有司具闻，帝令验之。实隋末有刘珍修道于泸州之安乐山，一旦取丹经钟磬封于石室曰：“后六十年，当有圣君取之。”自即以火化。至是遣使取钟磬丹经以进，诏即地建延真观，亲书扁额。建观筑基，掘地得一石碑，云：“自后整六百年，北人当一天下。”帝命树此碑于山，以警后世。
庚辰改元永隆。诏行俭为定襄道大总管，大破突厥于黑山，进爵闻喜县公。辛巳改元开耀。壬午又改永淳。行俭有知人鉴。初，王勃、杨炯、卢照邻、骆宾王皆以文章齐名，号四杰。行简曰：“士之致远者，当先器识，而后才艺，勃等虽有文华，而浮躁浅露，岂享爵禄之器耶?杨子稍沉静，应至命长，.馀得令终幸矣。”后皆如其言。
行俭尝与照邻往见孙思邈，与语竟日，莫测其涯止，退谓卢曰：“犹龙之叹，兹复见矣。”是夏，行俭卒。秋八月，思邈卒，遗令薄葬，不藏冥器，不奠牲宰。经月余，颜色不改，举尸就木，空衣而已。所注有《老子》、《庄子》，撰《千金方》、《福禄论》各三十卷，《摄生真箓》、《枕中素书》、《会三教论》各一卷。
冬十月，突厥入寇并州，薛仁贵大破之。吐蕃寇河源军，娄师德八战八捷。帝为边境宁静，欲遍封五岳。尚辇奉御杨德祖以为天道宜奉，五岳宜封，帝嘉其请，作奉天宫于嵩阳。德祖乃隋太子勇之孙，酷好道，以炉鼎延生为务，官散俸薄，往往阙于粥，稍有百金，旋作炭药之值。
忽有凡八兄者，携一仆，诣谈玄虚，论方术以为金丹之制，不足为劳，黄白变化，咳唾可致。德祖深加尊敬。而凡之刚躁喧杂，嗜酒食饕，殊不可耐。昼出夜还，不畏街禁；肥鲜醇酎，非时即须。德祖了谙其性，委曲预备，必副所求，由是淹留数月。
一日，令取鼎釜枪锹等，陈于药房，凡自击碎之，垒铁加炭，烈火以锻焉，投散药方寸匕于上，及扃其室，背灯壁隅，乃与德祖庭中步月，中夜谓曰：“我太极仙人淮南子也，得安度明代守是职，与八宫复位震宫，校理仙籍，因思度世，托名凡八，游行南方。以子栖心至道，笃志不回，故来相教耳。明月良夜，能远游乎?”德祖诺，遂相与出门。
约行三十里，路颇平，憩一山顶，八兄曰：“此去长安千里矣，当甚劳乎?”德祖惊其且远，亦以行倦为对。八兄长啸，逡巡有白兽至，命乘之，其行迅疾，渐觉弥远，因问长安里数，曰：“八万里。”德祖悄然，忽念未别家小，白兽屹立不行。八兄笑曰：“果有尘俗之念，去世未得。”遽命送诣云宫谒解空法师。
俄顷至，法师延坐，使青童以金丹饲之，德祖接视，俱毒鳌之物；又命饮以玉浆，闻之，臭不能饮。法师叹息，令兽送还。至家，灯烛死然，犹未及曙。明晨视其所化，黄白灿然，虽资有馀，而八兄仙仪，杳不可睹。后忽见八兄之仆携筐莒过其门，问凡君所止，云在仙府，使我暂至人寰，若见奉御，令同来可也。
德祖即入朝辞帝，云将弃家远游。帝素知其有得，因问以治身之道，对曰：“孔圣有云：人能弘道，非道弘人。”敕百官饯送，德祖随仙仆径去。
癸未，改元弘道。帝患拘挛，召太子入侍。帝召侍中裴炎受遗诏而崩。哲即位。甲申，为嗣圣元年，册韦妃为后。太后废帝为庐陵王，立豫王且为帝，改元文明。太后居帝旦于别殿，迁帝哲于房州，诏立武氏七庙。英公李敬业起兵扬州，以匡复为辞，移檄州县。裴炎劝返政，太后怒，遣李孝逸讨之，敬业败逃，骆宾王等四逸。孝逸密取相似者二人斩首凯还。后知人心怨望，盛开告密之门，罗织无辜，中外畏之。